DNA电泳技术原理
根据DNA分子量不同，采用外加电场使其分开，用EB嵌入DNA分子后在紫外下显色。
琼脂糖凝胶电泳是利用琼脂糖溶化再凝固后能形成带有一定孔隙的固体基质的特性。
DNA分子在琼脂糖凝胶中泳动时有电荷效应和分子筛效应。
1） 在电场的作用下及中性pH的缓冲条件下，带负电的核酸分子向正极迁移。
由于糖一磷酸骨架在结构上的重复性质，相同数量的双链DNA几乎具有等量的净电荷，因此它们能以同样的速度向正极方向移动。
2） 在一定的电场强度下，DNA分子的迁移速度取决于分子筛效应，即DNA分子本身的大小和构型。
具有不同的相对分子质量和不同构型的DNA片段泳动速度不一样，可进行分离。
3） 溴化乙锭在紫外光照射下能发射荧光，当DNA样品在琼脂糖凝胶中从负极向正极泳动时，溴化乙锭从正极向负极移动，这样溴化乙锭分子就会嵌入DNA分子中形成络合物，使DNA在紫外光下发射很强的荧光。
在溴化乙锭足够的情况下，荧光的强度正比于DNA的含量，这样就可以检测DNA的浓度。
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垂直电泳槽漏液的原因
电泳槽密封条漏液的原因与处理（垂直槽）
一般情况下，小型转印电泳槽供应商，电泳槽较窄的密封条不易漏夜，反之较宽的则比较容易漏，发现电泳槽漏液时要检查：
1、密封条是否老化或损坏，若已经老化或损坏，应更换密封条。
2、如果密封条完好无损，目测检查密封条是否有凹凸不平现象，如果有应将密封条拆下进行重新安装。
安装时注意不要拉扯密封条，使其自然地嵌入密封槽内，并保证安装均匀，避免密封条出现凹凸现象。
3、如果缓冲液是从密封条的中间漏出，则说明漏处比两边凹（不在同一水平线上），我们则需要把密封条拆下，清理干净槽内胶粘剂，然后再将薄厚相当的窄边条（如0.4毫米）粘在槽内，以垫起凹下的密封条，使其与两边保持一致，此后再将密封条粘在槽内即可。
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核酸电泳常用染色液
1、溴化乙锭（ethidium bromide， EB）
较为常用的核酸荧光染料，小型转印电泳槽，可嵌入核酸双链的配对碱基之间，在紫外线激发下，发出桔红色荧光。
EB-DNA复合物中的EB发出的荧光，比游离的凝胶中的EB发出的荧光强度大10倍，小型转印电泳槽批发，因此无需洗净背景即可清楚观察核酸带型。
若EB背景太深，可将凝胶 浸泡于1mmol/LMgSO4中1h或10mmol/L MgCI2中5min，使非结合的EB褪色，这 样可检查到10ng的DNA样品，EB也可用于检测单链DNA或RNA，但其对单链核酸的亲和力相对较小，荧光产率也相对较低。
2、吖啶橙（acridine orange， AO）：
吖啶橙可嵌入双链核酸碱基对之间，在254nm紫外线激发下发出530nm的绿色荧光；还通过静电与单链核酸的磷酸基结合，在254nm紫外线激发 下产生640nm的红色荧光。
因此可区分单链和双链核酸，小型转印电泳槽生产厂家，灵敏度分别为0.1μg和0.05μg。
但吖啶橙的染色操作要求严格，应在 22℃，0.01mol/L磷酸钠缓冲液（pH7.0）中避光浸泡30min，然后在搪瓷盘中用该缓冲剂4℃脱色过夜或22℃脱色1~2小时。
3、亚甲蓝（methylene blue）
可将RNA染成蓝色，但灵敏度不高，而且操作时间长。
染色过程：胶浸泡于0.02%的亚甲蓝，10mmol/L Tris-Ac（pH8.3），4℃放置1~2h，用净水洗5~8h（反复换水），带型肉眼可见，较低检测量为 250ng。
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